More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2341 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  100 
 
 		 226 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  50.28 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  49.16 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 337 aa  146  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  46.86 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  45.12 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  39.34 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  37.91 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  46.46 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  44.29 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.91 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  41.06 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  36.4 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.26 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  38.57 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  35.43 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  33.94 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  45.36 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  39.9 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.56 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  38.84 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.29 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  37.75 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.47 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  36.02 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  40.59 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.29 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  35.34 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.97 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  35.11 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  34.5 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.69 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.7 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  38.85 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  44.12 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  30.04 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.06 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  38.85 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  39.61 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.04 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.19 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  33.18 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  36.36 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.4 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  34.58 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  33.96 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.6 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  34.09 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.82 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  26.96 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  41.32 
 
 		 202 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 262 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.08 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  37.19 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.72 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.77 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.53 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  33.96 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  35.27 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.53 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  35.27 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  36.63 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.34 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.53 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>