More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2703 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 225 aa  356  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  79.55 
 
 		 337 aa  346  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  58.67 
 
 		 225 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  56.44 
 
 		 225 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  53.92 
 
 		 231 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  53.02 
 
 		 229 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  43.12 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.79 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  44.14 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  43.06 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  38.03 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  43.08 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  37.95 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  43.5 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  34.38 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.68 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  36.02 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  37.61 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  38.57 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  39.91 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.44 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  42.2 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.7 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  38.16 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  37.09 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 216 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  36.97 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  36.07 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  39.5 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  30.81 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.55 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  35 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  35.75 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  30.29 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  37.57 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.95 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  35.64 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  36.19 
 
 		 239 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 250 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.48 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.22 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.84 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.49 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.75 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.75 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.1 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.75 
 
 		 256 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  35.21 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  35.37 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.56 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.95 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 379 aa  85.5  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  38.92 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.63 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.59 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  31.96 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.04 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  32.04 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>