More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1578 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  100 
 
 		 230 aa  473  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  69.13 
 
 		 230 aa  343  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  40.49 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  41.2 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  37.9 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  45.2 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  44.63 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  41.38 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  37.56 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  36.99 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  38.07 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.28 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.61 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  33.78 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  36.73 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  37.21 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  37.62 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  33.66 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  31.53 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  35.29 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  37.16 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  33.33 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  33.64 
 
 		 217 aa  112  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.8 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36.21 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  31.08 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  31.08 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.06 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  33.62 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  30.52 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.8 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  34.33 
 
 		 240 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  32.62 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  33.02 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  35.64 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  26.79 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.6 
 
 		 245 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.16 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  30.57 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  38.1 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  31.11 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  33.78 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.39 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.94 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  34.31 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.45 
 
 		 268 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  31.42 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  27.75 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  31.7 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  36.09 
 
 		 252 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 268 aa  91.7  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.57 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  34.73 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  32.44 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  33.51 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  32.44 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  32.44 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.51 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>