More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9327 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  453  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  82.06 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  49.13 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  50.68 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  61.02 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  49.33 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  51.18 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  50.72 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  49.75 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  43.52 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  42.44 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  46.23 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  48.22 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  42.44 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  40.62 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  45.5 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  49.07 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.17 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  48.73 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  41.62 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  41.04 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  37.32 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.28 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  42.71 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  42.33 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  40.27 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.95 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  42.08 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.67 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  39.37 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  41.35 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  43.37 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.07 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  42.34 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 337 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  49.16 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.89 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  33.02 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  34.36 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  41.36 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  40.55 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.09 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  32.07 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  41.88 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.18 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.41 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 253 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  37.13 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  40.81 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.64 
 
 		 299 aa  98.6  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.26 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.03 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 218 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  36.96 
 
 		 246 aa  95.5  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  37.73 
 
 		 242 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 247 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  35.61 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  35.32 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  39.66 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  35.48 
 
 		 284 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.51 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.07 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  38.32 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>