More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0632 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0632  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
233 aa  450  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  30 
 
 
254 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.22 
 
 
223 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  32.11 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  29.52 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.55 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  29.6 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  29.77 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.7 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  36.7 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.42 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  32.74 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
268 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 
235 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  26.56 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  30.38 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  32.7 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.71 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  27.62 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  33.63 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  30 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.08 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.8 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  26.04 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  32.66 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  30.85 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  32 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.51 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  27.83 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.69 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.81 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.13 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.51 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  31.14 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  36.02 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  35.14 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  27.42 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  27.4 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  25.99 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  24.88 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  31.82 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  31.66 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.42 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.85 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.48 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.85 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
255 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
258 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.54 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.84 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  24.44 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.18 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.34 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.37 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  32.99 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>