More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0503 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  81.62 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.78 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  38.18 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  32.52 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  34.25 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  32.46 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  30.73 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  29.86 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.34 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 252 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 299 aa  88.2  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  31.22 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  34.08 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  29.68 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.2 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.26 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  31.19 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  30.35 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  29.65 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  31.76 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  31.96 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  32.7 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.66 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.13 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  32.63 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.13 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  30.74 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  37.35 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  34.25 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  32.02 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  31.82 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  33.79 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.57 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  35.85 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  28.9 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.43 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  30.66 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  31.43 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  32.05 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  28.92 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>