More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0426 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.7 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.53 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32.95 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  30.96 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.5 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.84 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.96 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  35.37 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.29 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.23 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  36.42 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.1 
 
 		 215 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  31.69 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.3 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.55 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.18 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  30.04 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.71 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  33.63 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.91 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  41.23 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.12 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.12 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.12 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  47.57 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  30.39 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.18 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  30.04 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.94 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.1 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  41.23 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.52 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  26.17 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  30.49 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  38 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28.3 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  37.79 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  28.77 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.3 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  29.61 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  29.61 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  29.61 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  29.61 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  31.09 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  29.61 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>