More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2274 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
232 aa  466  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
233 aa  244  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  43.91 
 
 
239 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  43.97 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  42.15 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  41.7 
 
 
239 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  40.77 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  37.34 
 
 
238 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  36.48 
 
 
241 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  38.46 
 
 
240 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
241 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  36.24 
 
 
240 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  36.24 
 
 
243 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  35.81 
 
 
240 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 
239 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.36 
 
 
257 aa  135  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.93 
 
 
258 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.5 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.5 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.96 
 
 
258 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.09 
 
 
258 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  34.65 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.21 
 
 
258 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.06 
 
 
258 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 
255 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 
215 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.61 
 
 
228 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 
239 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
257 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
249 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.18 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
255 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 
255 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
255 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 
218 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 
235 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
257 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 
257 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.12 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.68 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.72 
 
 
231 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.79 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
218 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
255 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.75 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  30.25 
 
 
261 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
248 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  31.93 
 
 
254 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  33.18 
 
 
251 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.44 
 
 
230 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 
258 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  31.03 
 
 
254 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 
254 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 
254 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 
254 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 
254 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.61 
 
 
254 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
235 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.51 
 
 
255 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  30.32 
 
 
239 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  30.51 
 
 
231 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.74 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.77 
 
 
248 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
255 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  29.74 
 
 
255 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 
255 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
239 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
239 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
239 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
318 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>