More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3816 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  99.61 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  99.61 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  99.61 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  99.22 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  87.21 
 
 		 258 aa  477  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  86.43 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  86.43 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  86.43 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  86.43 
 
 		 258 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  84.11 
 
 		 257 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  47.62 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  45.31 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  41.74 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  42.32 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  39.22 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  41.57 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  41.09 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  41.09 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  37.92 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  39.32 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  37 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  35.62 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  35.62 
 
 		 254 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  36.56 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  35.54 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  36.28 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  37.89 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  37.44 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  39.92 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  35.37 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  39.91 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  38.1 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 318 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  36.12 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  35.83 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  36.12 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 366 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  36.12 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  34.73 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  38.68 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  32.11 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  34.73 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  34.73 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  34.73 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  36.36 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  36.1 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  34.31 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.82 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  33.89 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  33.88 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.47 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.38 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.89 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30.86 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  33.92 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  34.47 
 
 		 253 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1719  GntR domain-containing protein  40.57 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  hitchhiker  0.00929417 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  32.63 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.48 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.08 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>