More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2081 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 366 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  96.75 
 
 		 318 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 239 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  96.05 
 
 		 228 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 248 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  62.34 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  199  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 261 aa  156  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  39.67 
 
 		 255 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  40.85 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  40.43 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  41.7 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  41.26 
 
 		 248 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 255 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  39.67 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 255 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  39.67 
 
 		 255 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  38.98 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  39.48 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  38.98 
 
 		 261 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  39.91 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  39.91 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  39.06 
 
 		 254 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  39.06 
 
 		 254 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  39.91 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  39.91 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  39.91 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  39.06 
 
 		 254 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 258 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  37.23 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 241 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  38.89 
 
 		 239 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.01 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.36 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.91 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  39.01 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  37.44 
 
 		 270 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 257 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  36.2 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.57 
 
 		 258 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  40.36 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  38.7 
 
 		 256 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  36.07 
 
 		 251 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  39.91 
 
 		 257 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  36.96 
 
 		 239 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  34.25 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  35.65 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  37.23 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.57 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.57 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 		 256 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.57 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  38.57 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.22 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 255 aa  139  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  36.56 
 
 		 256 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  35.93 
 
 		 255 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  36.84 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  38.74 
 
 		 270 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  41.33 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  34.8 
 
 		 250 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  35.96 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 		 250 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  34.2 
 
 		 250 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  133  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.48 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.82 
 
 		 255 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.65 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>