More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0306 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  98.68 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  37.73 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.02 
 
 		 245 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.04 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.04 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.53 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.63 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.65 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.34 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.22 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.34 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.57 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.09 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.74 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.93 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 		 285 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.6 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  26.96 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  31.67 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.12 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.09 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.17 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  27.62 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  26.96 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  30.41 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  29.03 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  25.66 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.09 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  25.65 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  34.08 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 318 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  27.04 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  26.69 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.35 
 
 		 268 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  25.23 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.57 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 303 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  25.11 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  25.94 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 288 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  25.88 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  24.34 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  28.44 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  30.59 
 
 		 234 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  25.22 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  24.34 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  24.34 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  27.19 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  24.34 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>