More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  62.73 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  61.82 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  60.55 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  56.56 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  54.19 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  49.3 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  54.7 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  52.33 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  43.58 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  46.38 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  51.83 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  44.28 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  51.2 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  43.93 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  39.45 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  44.71 
 
 		 252 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  43.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  41.9 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.4 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  41.98 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  47.09 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  36.07 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  44.02 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  40.37 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  43 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  39.45 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 337 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  45.03 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  44 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  35.14 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.89 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 226 aa  121  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.14 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.65 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.43 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  37.14 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.95 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.04 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.64 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.61 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.55 
 
 		 240 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.64 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30.92 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.36 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.98 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.36 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  42.94 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.62 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.57 
 
 		 249 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  33.63 
 
 		 271 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.71 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.24 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.76 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.22 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  34.11 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.03 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.86 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  39.77 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  37.05 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  36.32 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.62 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>