More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  50 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  42.06 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 231 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  46.34 
 
 		 229 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  43.86 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  46.71 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  36.49 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  37.05 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  34.68 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  40 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.78 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  38.18 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  35.03 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.89 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  36.73 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  39.88 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  37.95 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  39.09 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  39.88 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  37.95 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  37.21 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  45.7 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  40.91 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  38.5 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  31.37 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  38.01 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  37.61 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.32 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 244 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  38.86 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.62 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  38.18 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  37.42 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.01 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.35 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.55 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  38.12 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  35.68 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  35.68 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  33.52 
 
 		 252 aa  95.9  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  35.21 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.53 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.11 
 
 		 273 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.8 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  37.5 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.86 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.58 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.52 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  36.12 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  38.06 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.4 
 
 		 238 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  38.02 
 
 		 268 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  33.98 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  35.19 
 
 		 248 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  41.26 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  36.11 
 
 		 253 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.94 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>