More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1794 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  64.81 
 
 
241 aa  261  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  56.68 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
221 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  47.03 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  46.82 
 
 
230 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
221 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 
221 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  54.34 
 
 
235 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  52.33 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  54.07 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  45.25 
 
 
233 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  46.01 
 
 
224 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  43.89 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  47.24 
 
 
222 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  50.58 
 
 
233 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  46.7 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  48.26 
 
 
226 aa  147  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  37.91 
 
 
230 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  45.85 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  43.94 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  36.99 
 
 
230 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  41.12 
 
 
226 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.07 
 
 
226 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
215 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
226 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  44.33 
 
 
224 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  39.39 
 
 
231 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 
235 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  40.1 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
225 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  37.96 
 
 
229 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  35.94 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
337 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.66 
 
 
216 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  40.64 
 
 
234 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
216 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
222 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  36 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.19 
 
 
225 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  38.97 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.18 
 
 
231 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  36.18 
 
 
225 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.36 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  35.68 
 
 
231 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
257 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 
257 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.42 
 
 
257 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  42.69 
 
 
226 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  36.02 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
258 aa  98.6  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  37.78 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  37.78 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  37.78 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  37.78 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  37.78 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35.92 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  34.8 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.62 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.96 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  37.7 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
255 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 
255 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  37.04 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.9 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  36.67 
 
 
254 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  41.18 
 
 
264 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.47 
 
 
258 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  34.44 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.9 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.9 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.9 
 
 
258 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  32.85 
 
 
254 aa  92  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.86 
 
 
241 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  41.38 
 
 
250 aa  92  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.49 
 
 
256 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
233 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.66 
 
 
238 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  35 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  35 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>