More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0903 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  100 
 
 		 224 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  47.18 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  44.33 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  38.1 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  43.33 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  43.66 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  37.21 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  42.36 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  41.55 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  45.39 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.5 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  42.16 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  41.36 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  40.84 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  43 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  43.41 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  40.5 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  42.16 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  39.46 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.5 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  43.12 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.65 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  38.12 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  43.35 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  34.25 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 337 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  34.55 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  40.59 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.37 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  37.43 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.92 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  36.36 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.31 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.88 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  34.5 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  33.48 
 
 		 267 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.61 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  36.04 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.02 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.15 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.8 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.77 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  35.11 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  30.67 
 
 		 242 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  33.66 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 255 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  37.95 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  34.54 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.46 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.46 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.46 
 
 		 258 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  30.69 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.77 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.42 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.63 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.86 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  29.88 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  30.59 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 251 aa  85.5  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.36 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.03 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>