More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2216 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  45.85 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  44.71 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  43.15 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  40.99 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  44.97 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  36.73 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  44.66 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  40.55 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  35.62 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  40.31 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  40.36 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  44.39 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  45.03 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.2 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  36.11 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.95 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  36.87 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.44 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  34.67 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  38.94 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  33.77 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 337 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  40.22 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  36.57 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.82 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.23 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  34.76 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  40.49 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  38.12 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.98 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.22 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6080  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  35.27 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  38.39 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 235 aa  94.7  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  33.93 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.07 
 
 		 250 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  38.37 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  38.6 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.88 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 240 aa  88.2  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.65 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.12 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.65 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.91 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  27.5 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.14 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  31.17 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.2 
 
 		 268 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  30.36 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  29.17 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  31.58 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  35.8 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.09 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.27 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.13 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.91 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  29.69 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  33.72 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  32.09 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  34.29 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.61 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>