More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0977 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  68.57 
 
 
216 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  67.61 
 
 
216 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  67.61 
 
 
216 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
216 aa  294  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
215 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  53.74 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 
226 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
235 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.96 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  44.98 
 
 
224 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
221 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  47.27 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  38.86 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  40.3 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  43.86 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  39.44 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
221 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
221 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  35.89 
 
 
225 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  40.69 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
231 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  42.94 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  40 
 
 
224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  35.55 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
225 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  35.68 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 
226 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 
225 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 
233 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  41.04 
 
 
233 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.39 
 
 
230 aa  118  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  37.74 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  37.12 
 
 
224 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.42 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  36.41 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  35.21 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.66 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  33.8 
 
 
225 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  35.78 
 
 
226 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  41.41 
 
 
227 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.05 
 
 
222 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  30.23 
 
 
218 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.1 
 
 
264 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  39.72 
 
 
234 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
230 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
222 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  36.84 
 
 
240 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  29.38 
 
 
222 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  36.72 
 
 
239 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.38 
 
 
231 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 
235 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 
235 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.25 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  41.38 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  35.68 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.88 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.33 
 
 
241 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1150  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.88 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  36.18 
 
 
224 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  29.58 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.75 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.14 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.7 
 
 
254 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.29 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  29.11 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.29 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
247 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  31.75 
 
 
234 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.39 
 
 
256 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.1 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.04 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.66 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.06 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
246 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.13 
 
 
255 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  41.56 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.53 
 
 
243 aa  89  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
245 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
268 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  32.08 
 
 
254 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.43 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  35.16 
 
 
255 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.63 
 
 
259 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.13 
 
 
259 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.97 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.08 
 
 
242 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>