More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0016 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  78.57 
 
 		 225 aa  338  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  64.09 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  61.82 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  63.18 
 
 		 221 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  57.08 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  57.06 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  55.37 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  45.25 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  47.95 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  53.3 
 
 		 233 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  42.92 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  44.66 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  48.54 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  44.08 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  40.72 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  38.07 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  40.64 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  48.78 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  44.44 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  43.89 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  36.36 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  41.95 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  38.6 
 
 		 225 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  47.96 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 337 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  42.41 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  36.78 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  39.01 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  43.66 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.63 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.04 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.33 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  37.02 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  36.27 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  41.57 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  40.33 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.16 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.59 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.13 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.75 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  40.43 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.96 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.6 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.67 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.94 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.97 
 
 		 268 aa  94.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  36.74 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  44.17 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.25 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.07 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.54 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 		 215 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.56 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.06 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.02 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.41 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.79 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.41 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.15 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.5 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.3 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.45 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  37.58 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.94 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  35.88 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>