More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2805 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  74.11 
 
 
226 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  44.95 
 
 
225 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
221 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  45.92 
 
 
234 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  42.92 
 
 
233 aa  158  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  46.33 
 
 
235 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
221 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  49.28 
 
 
221 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  51.83 
 
 
226 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  41.51 
 
 
230 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  48.26 
 
 
224 aa  147  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
231 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  43.72 
 
 
223 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  37.28 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  44.44 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.22 
 
 
230 aa  139  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.83 
 
 
233 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
215 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  38.89 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.44 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  42.64 
 
 
215 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  40.12 
 
 
226 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.13 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  38.95 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
235 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  40.2 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  39.07 
 
 
225 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
225 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  40.4 
 
 
224 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  41.55 
 
 
224 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
337 aa  122  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  41.63 
 
 
224 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  37.32 
 
 
231 aa  121  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  37.79 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  46.15 
 
 
227 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.57 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  37.95 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  38.71 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
230 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
219 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  37.19 
 
 
216 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.03 
 
 
239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
216 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  33.66 
 
 
218 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  33.66 
 
 
222 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  38.43 
 
 
231 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.4 
 
 
229 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  35.71 
 
 
226 aa  101  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 
216 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  35.12 
 
 
222 aa  98.2  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  32 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  31.11 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.02 
 
 
245 aa  94.7  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  33.63 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  39.46 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  34.39 
 
 
224 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.63 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.61 
 
 
235 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33.17 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.74 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.28 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.73 
 
 
245 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 
253 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.27 
 
 
257 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  38.75 
 
 
253 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  30.08 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  35.12 
 
 
252 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  26.34 
 
 
239 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  31.42 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.73 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  30.83 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  30.43 
 
 
260 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  32.09 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0593714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  30.43 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.04 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  30.43 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
274 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  29.77 
 
 
250 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 
268 aa  85.5  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  30.51 
 
 
260 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  30.51 
 
 
260 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>