More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  100 
 
 
223 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  67.58 
 
 
221 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  67.58 
 
 
221 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  67.58 
 
 
221 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  56.56 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  58.26 
 
 
225 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  57.08 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  52.21 
 
 
231 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  57.63 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 
229 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  53.95 
 
 
233 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  47.03 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  52.17 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  49.03 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  42.27 
 
 
241 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  43.89 
 
 
252 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  46.54 
 
 
217 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  37.9 
 
 
230 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  48.29 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  40.85 
 
 
229 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  42.53 
 
 
226 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  40.28 
 
 
230 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  45.28 
 
 
222 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
226 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  46.15 
 
 
224 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
225 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
337 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  43.72 
 
 
226 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  40.91 
 
 
215 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  47.11 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
235 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  47.18 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  37.32 
 
 
226 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.5 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  38.79 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  38.03 
 
 
225 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  40.19 
 
 
231 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.26 
 
 
225 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  39.59 
 
 
231 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  35.85 
 
 
225 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  38.5 
 
 
216 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  36.57 
 
 
231 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  36.87 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  33.99 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 
240 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.96 
 
 
229 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  31.6 
 
 
222 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  39.58 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.59 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32.59 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  40.7 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
223 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.27 
 
 
237 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.25 
 
 
242 aa  93.6  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  38.51 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.33 
 
 
268 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  27.68 
 
 
239 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.81 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  33.15 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  38.38 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.11 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.11 
 
 
228 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  34.41 
 
 
240 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.06 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 
238 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  33.17 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.71 
 
 
258 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
268 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
255 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  36.26 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  35.76 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.32 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  34.13 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 
245 aa  85.1  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.15 
 
 
235 aa  85.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  35.16 
 
 
272 aa  85.1  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 
264 aa  85.1  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.51 
 
 
261 aa  85.1  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 
221 aa  84.7  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>