More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1117 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  59.35 
 
 		 222 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  47 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.28 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  38.28 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  39.71 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 235 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.21 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  37.21 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.12 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.66 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  38.51 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  34.48 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.65 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.99 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.34 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  32.5 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  34.36 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  32 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  38.41 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.49 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  33.66 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  31.13 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  31.46 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  33.82 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 255 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 238 aa  98.2  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  31.86 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  30.29 
 
 		 216 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  30.39 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 237 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  30.33 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  36.87 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 258 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.08 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  32.42 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  38.93 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  30.33 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  30.73 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 337 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  32.11 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  32.11 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  38.93 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.33 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 248 aa  91.3  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  29.82 
 
 		 263 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  30.45 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  36.63 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>