More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1180 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  100 
 
 
231 aa  470  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  40.49 
 
 
230 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  40.3 
 
 
230 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 
231 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  43.98 
 
 
235 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  39.39 
 
 
224 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  37.33 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  41.95 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  40.19 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
226 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 
215 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
215 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
226 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.32 
 
 
226 aa  121  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  43.71 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  35.21 
 
 
226 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
235 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.56 
 
 
222 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  37.25 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  41.57 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  35.85 
 
 
216 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  36.79 
 
 
241 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.45 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
216 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  38.64 
 
 
225 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  34.98 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  35.06 
 
 
238 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  36.1 
 
 
231 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  31.82 
 
 
225 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  37.44 
 
 
217 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.43 
 
 
229 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.13 
 
 
222 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
226 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
225 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
337 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.11 
 
 
239 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  32.38 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.88 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
235 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.41 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  31.9 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  37.17 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.22 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.54 
 
 
255 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.22 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  34.72 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  30.29 
 
 
222 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.56 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.5 
 
 
250 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  35.07 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  30.77 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.55 
 
 
238 aa  92  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  33.94 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
218 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.31 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  32.84 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
218 aa  89  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  34.55 
 
 
224 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
257 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
218 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  34.81 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  35.22 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.81 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
236 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  33.55 
 
 
264 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  29.74 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  31.61 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  31.12 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>