More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2978 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  37.09 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.94 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  34.84 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  34.82 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  34.27 
 
 		 291 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.84 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.1 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  35.55 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 268 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.48 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  36.63 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  30.84 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.18 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.09 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  31.63 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.14 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  31.47 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.36 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  29.39 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.41 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.9 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  29.09 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.38 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  31.03 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  32.57 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.53 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.91 
 
 		 241 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 337 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  30.62 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  29.44 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.1 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  30.26 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  30.33 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  30.46 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.69 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.19 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  29.11 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  32.42 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.46 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.41 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  32.23 
 
 		 278 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  32.23 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  27.35 
 
 		 338 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.13 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.13 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  32.18 
 
 		 237 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>