More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2102 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  82.68 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  82.68 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  69.29 
 
 		 268 aa  313  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  76.99 
 
 		 255 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 234 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  33.61 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  35.4 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  38.86 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  38.86 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 230 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  32.02 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 230 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  34.75 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  34.32 
 
 		 291 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  34.19 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.05 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  36.09 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  37.27 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6475  GntR-like  40.18 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6316  GntR domain-containing protein  40.18 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855899  normal  0.236582 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6710  GntR domain-containing protein  40.18 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  37.2 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.82 
 
 		 239 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  33.33 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.47 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.44 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.7 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  35.14 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  32.02 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.09 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30.09 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30.09 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30.09 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30.09 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  33.76 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.2 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  32.63 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.93 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  33.79 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  30.7 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2064  GntR domain protein  36.57 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  34.16 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  32.87 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.64 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  34.16 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  34.16 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  30.9 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>