More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4879 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  80.09 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  79.06 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  79.22 
 
 		 232 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  79.22 
 
 		 232 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  55.26 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  54.82 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.62 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  30.04 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  34.04 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  34.04 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  30.87 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  31.44 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 268 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  30.94 
 
 		 291 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.44 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  30.23 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  31.86 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.43 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.35 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  29.19 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  29.95 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  24.76 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  29.95 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  28.69 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  30.26 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.39 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.43 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.68 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  33.53 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  29.81 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  33.14 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.07 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  29.02 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  31.46 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01468  putative regulatory protein, GntR family  31.6 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.09 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  26.87 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  30.6 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.1 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  34.08 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  30.59 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.83 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  29.33 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>