More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3389 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  97.83 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  82.97 
 
 		 230 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  86.03 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  85.15 
 
 		 230 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  85.59 
 
 		 230 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  80.87 
 
 		 230 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  81.74 
 
 		 239 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  81.74 
 
 		 239 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  81.74 
 
 		 230 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  81.74 
 
 		 240 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  81.74 
 
 		 291 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  79.13 
 
 		 240 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  53.81 
 
 		 262 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  48 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  43.97 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  43.53 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  33.74 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  33.74 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.61 
 
 		 254 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 234 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  30.99 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  34.33 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  37.13 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  31.58 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.88 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  32.7 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.19 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.07 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.59 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.43 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 270 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 270 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.33 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  29.6 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.07 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  32.35 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.22 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.77 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.22 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.33 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.22 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.57 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.14 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.44 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.73 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.49 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.49 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  28.97 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.97 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.25 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.97 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.97 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  28.97 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.97 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  28.97 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  30.57 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>