More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0453 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  54.17 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  48.95 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  40.76 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  34.31 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  36.02 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  34.45 
 
 		 256 aa  111  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.81 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  32.35 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.81 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  29.92 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.12 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  26.64 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  32.35 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  24.89 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  26.94 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  32.17 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.18 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  33.05 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  27.69 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  27.69 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  23.91 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  26.81 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  27.69 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  26.78 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  27.11 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  27.78 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  23.91 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  27.8 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.78 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  25.47 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  25.97 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  26.14 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  28.11 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.63 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  28.19 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.46 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  24.48 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.03 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  26.43 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  27.43 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  27.98 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.03 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  27.92 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.57 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.81 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  28.11 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  26.75 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  25.64 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  28.45 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  23.25 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  29.83 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.21 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  28.45 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  26.34 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  25.2 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>