More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  100 
 
 
228 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  97.8 
 
 
228 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  54.82 
 
 
234 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  54.67 
 
 
232 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  54.67 
 
 
232 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  54.79 
 
 
234 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  54.17 
 
 
234 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  36.73 
 
 
254 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
255 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  36.36 
 
 
254 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 
227 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  36.36 
 
 
254 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
245 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 
230 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 
234 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  35.85 
 
 
234 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.21 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  31.82 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.84 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.72 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
239 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
239 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
239 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
318 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  30.09 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.17 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
366 aa  85.1  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  33.33 
 
 
291 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  29.63 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  31.48 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  30.41 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  27.73 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  28.64 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  25 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  33.63 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  32.56 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.7 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.91 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
234 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
255 aa  82  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.17 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  27.78 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.82 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  28.64 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  31.98 
 
 
234 aa  79  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  29.95 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.11 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  31.28 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>