More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2462 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  99.57 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  99.57 
 
 		 230 aa  460  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  97.83 
 
 		 230 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  85.59 
 
 		 230 aa  400  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 234 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  82.1 
 
 		 230 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  84.28 
 
 		 230 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  84.65 
 
 		 239 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  84.65 
 
 		 239 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  85.09 
 
 		 240 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  85.09 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  85.09 
 
 		 230 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  82.89 
 
 		 240 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  53.36 
 
 		 262 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  46.67 
 
 		 227 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  44.21 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  35.29 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 234 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  34.85 
 
 		 254 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  31.92 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  34.85 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 234 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  35.19 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.09 
 
 		 255 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.42 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.42 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  34.95 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 255 aa  97.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.53 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.53 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  31 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.7 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  30.23 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.23 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.23 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.23 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.14 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.14 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.14 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.23 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.88 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  30.23 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.23 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.01 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.12 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.91 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 337 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1035  transcriptional regulator PdhR  32.84 
 
 		 278 aa  88.6  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3364  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0485553  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3492  transcriptional regulator PdhR  31.9 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.593618  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.64 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  31.65 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.56 
 
 		 270 aa  86.3  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.63 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.56 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  26.75 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  29.66 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.66 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>