More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTOA0035 on replicon NC_004633
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  57.94 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  53.68 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1596  GntR domain-containing protein  53.88 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387143  hitchhiker  0.00000232868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1641  GntR-like  45.02 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.39 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.35 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  35.43 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 249 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  33.92 
 
 		 273 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  34.76 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 248 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.47 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  34.06 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  29.78 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  32.91 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1789  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.612124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35.55 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.61 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.48 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.98 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  31.9 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.53 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  36.77 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  34.81 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.48 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.6 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  29.39 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  31.74 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  30.41 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.89 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  29.91 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  33.89 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  28.9 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  30.14 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  32.88 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  30.08 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.43 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  34.76 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  32.31 
 
 		 252 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  32.73 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 270 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.44 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  32.73 
 
 		 238 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>