More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1996 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
252 aa  148  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
233 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 
240 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.03 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.05 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  36.92 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  37.5 
 
 
241 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  35.45 
 
 
245 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.43 
 
 
230 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31 
 
 
238 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.58 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  35.95 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.38 
 
 
249 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.36 
 
 
255 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 
239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  35.98 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.98 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
255 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.64 
 
 
234 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
249 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.47 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  30.8 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  34.09 
 
 
239 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  36.79 
 
 
224 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.94 
 
 
233 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
247 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
256 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  36.78 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
288 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  34.76 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.09 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 
218 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  34.74 
 
 
250 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  36.76 
 
 
242 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 
218 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  36.36 
 
 
235 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  36.45 
 
 
234 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 
235 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  34.22 
 
 
240 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
255 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  32.54 
 
 
218 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
247 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.26 
 
 
236 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
218 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.21 
 
 
272 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 
218 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  34.55 
 
 
242 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
218 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  34.89 
 
 
239 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.35 
 
 
239 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
218 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
218 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
218 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  39.31 
 
 
229 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
268 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  36.71 
 
 
238 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 
218 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
231 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 
239 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  35.11 
 
 
268 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  40.33 
 
 
233 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.04 
 
 
268 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  33.48 
 
 
231 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32 
 
 
240 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 
230 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 
249 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  31.49 
 
 
249 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  31.49 
 
 
249 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  31.49 
 
 
249 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  31.49 
 
 
249 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
231 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.98 
 
 
247 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
268 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.51 
 
 
273 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  33.49 
 
 
222 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 
245 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
242 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32 
 
 
240 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
247 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.05 
 
 
251 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  39.88 
 
 
235 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
232 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
235 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 
253 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
248 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 
268 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
235 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 
243 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>