More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3396 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  35.42 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  35.65 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.2 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  32.76 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.84 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  39.88 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.87 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  31.44 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.62 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  35.56 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.48 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.79 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.87 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.28 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 288 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  32.46 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.17 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  31.53 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.69 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.95 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.04 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  37.57 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.09 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  31.49 
 
 		 270 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  26.75 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.91 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 285 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  31.14 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 366 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.3 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  31.44 
 
 		 271 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  30.4 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.96 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  31.14 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.22 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.33 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.42 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  29.74 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.71 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.22 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  28.99 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.81 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.81 
 
 		 256 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.12 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  33.53 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  28.38 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.52 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.86 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  28.03 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.46 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.86 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.73 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.04 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  32.26 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  29.29 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  28.57 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.21 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  27.87 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>