More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1986 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  85.89 
 
 		 241 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  42.32 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  37.39 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  33.77 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  32.41 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 317 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 340 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  32.7 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  36.57 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  36.36 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  31.36 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 238 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  32.14 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  28.45 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  27.54 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  25.21 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  34.82 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  29.03 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.26 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  27.27 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  29.03 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  25.42 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  30.45 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.15 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.77 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  24.38 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  27.92 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  36.07 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  26.89 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.99 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  23.93 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  28.03 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  34.21 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  29.71 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  27.46 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  26.61 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  33.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  32.16 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  33.88 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  26.64 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  29.15 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  33.88 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  27.08 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.16 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.14 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  32.74 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  33.64 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  26.45 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  33.06 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  27.22 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  27.22 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  27.22 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.05 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  27.22 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  33.06 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  27.57 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  26.01 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  37.01 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  37.01 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>