More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3282 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 218 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  35.06 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  37.78 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.17 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.42 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  31.9 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.8 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.61 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 241 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  31.58 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  34.66 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 236 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  34.66 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  30.32 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.22 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.81 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.91 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  30.04 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  29.8 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  32.54 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  28.7 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  32.23 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.88 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  30.04 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  27.19 
 
 		 235 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 225 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.84 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  34.69 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  32.94 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 366 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.14 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  29.13 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.45 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.46 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  28.38 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  26.58 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  28.1 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  33.15 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  33.53 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  29.36 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.51 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  31.34 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.89 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.13 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  28.38 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  40.16 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  31.5 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  31.5 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  31.5 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>