More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3965 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  40.09 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  36.53 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.67 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.8 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.2 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.74 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  41.18 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.14 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.72 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.3 
 
 		 241 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  31.86 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  30.13 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.16 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  35.52 
 
 		 257 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  33.91 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.64 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.52 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 366 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  32.77 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  32.89 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  33.04 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  25.21 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  33.04 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  32.91 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  32.09 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 218 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.75 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  32.75 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.75 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  31.85 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.7 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  31.36 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  35.76 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  32.19 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  30.21 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  32.7 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  31.94 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  36.57 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  32.75 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  35.9 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  37.36 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  31.62 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.48 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.33 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  30.13 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.17 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  33.33 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.63 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  32.19 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  37.43 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>