More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4358 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  85.89 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  41.3 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 		 271 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  34.07 
 
 		 265 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  32.11 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  30.93 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  30.18 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  34.15 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  34.15 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 340 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 317 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  31.66 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  33.94 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30.77 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  29.12 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  23.81 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  30.46 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.03 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.26 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.86 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.79 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  27.39 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.28 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.55 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  26.99 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  34.91 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  30.77 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  26.01 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  25.1 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  28.51 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  28.19 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  28.96 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  31.68 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  30.37 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  29.95 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  27.19 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  29.86 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  27.68 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  28.32 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0790  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  34.02 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.13 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  28.44 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  25.73 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  26.61 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  26.01 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.03 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>