More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01758 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  549  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  41.13 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  37.3 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  37.3 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  39.01 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  35.62 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  37.44 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  34.41 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  32.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  32.38 
 
 		 279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  31.43 
 
 		 320 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  33.33 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  31.97 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  30.98 
 
 		 256 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.14 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  25.52 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  26.22 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  26.52 
 
 		 239 aa  86.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  34.92 
 
 		 275 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  26.24 
 
 		 241 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.57 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  33.14 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  29.27 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.21 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  28.74 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  28 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  25.99 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  28.9 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.22 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.39 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  26.18 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  28.35 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  26.99 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  26.98 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  25.81 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  28.07 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  31.1 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  31.48 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  23.81 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.96 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.86 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  25.56 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  27.43 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  27.78 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  25.33 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 268 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  27.11 
 
 		 244 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  24.26 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  28.57 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  27.11 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.51 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>