More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13077 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  984    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  49.9 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1688  GntR domain-containing protein  35.83 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0152268  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  28.46 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  27.95 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.51 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  27.27 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.27 
 
 		 243 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  28.5 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 252 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  25.31 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.81 
 
 		 242 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  33.54 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  23.77 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 261 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  23.77 
 
 		 259 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  24.34 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  30.92 
 
 		 267 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  24.34 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 261 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.03 
 
 		 255 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  28.27 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  27.71 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  27.01 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  25.82 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  27.9 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  29.6 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  28.07 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  30.53 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  29.55 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 238 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  31.22 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 243 aa  63.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  28.02 
 
 		 264 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  31.07 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  25.15 
 
 		 259 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  28.46 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  28.24 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.13 
 
 		 240 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  29.09 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  24.12 
 
 		 248 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  25.69 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  29.09 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  26.48 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  24.9 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  26.03 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  23.28 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  28.04 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  26.79 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  25.23 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  26.67 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  26.15 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  28.76 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1260  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0889  regulatory protein GntR, HTH  39.73 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  27.7 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  26.82 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  26.07 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  28.46 
 
 		 258 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 258 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  25.11 
 
 		 233 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  24.47 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  24.47 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  27.75 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>