162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0889 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0889  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 238 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1541  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  32.45 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  34.32 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  30.15 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  34.23 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  27.65 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  42.86 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  30.66 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  31.03 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  42.35 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2288  regulatory protein GntR HTH  47.22 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00127376  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  42.47 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1686  regulatory protein GntR HTH  47.22 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00156623  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  23.27 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  28.86 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1917  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000235972  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3218  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00133147  normal  0.894655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4358  regulatory protein GntR, HTH  29.84 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.557304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  29.45 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.48 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  31.12 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  30 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  30.61 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  25.45 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  27.52 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  55.56 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  26.37 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.82 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  33.16 
 
 		 272 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  28.71 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  26.04 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0868  regulatory protein GntR, HTH  38.89 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  29.55 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  27.27 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  29.55 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  40.28 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  27.08 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  32.26 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1688  GntR domain-containing protein  30.16 
 
 		 312 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0152268  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  46.58 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  29.21 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.7 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  31.69 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 282 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  27.51 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  28.65 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  24.75 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  26.7 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  27.35 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0962  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.213599  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  35.71 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  28.76 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  28.76 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  25.89 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  32.41 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  26.67 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.29 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  25.98 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  51.11 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.97 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  27.97 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  36.71 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  27.65 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6851  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.93 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  22.27 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  47.83 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  39.18 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>