More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3213 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 248 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  59.26 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  58.85 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  53.72 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  42.29 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  38.75 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  38.75 
 
 		 279 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  37.85 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  37.85 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  39.83 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  37.85 
 
 		 285 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  37.66 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  36.78 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  37.44 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  36.8 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  37.84 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  35.29 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  33.06 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  34.63 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 218 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.78 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.59 
 
 		 227 aa  88.6  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.45 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  31.09 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  28.9 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  27.53 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.22 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  29.15 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  24.56 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  28.26 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.16 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.7 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  27.19 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  25.1 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.23 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.44 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  25.42 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.43 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.26 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.44 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  26.27 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.15 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.15 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  28.84 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  32.56 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  26.61 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  26.89 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  31.54 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  27.83 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  25 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  25 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.73 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  25 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  25.93 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  27.05 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  25 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  28.57 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  26.15 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  25 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>