More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4268 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 277 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  78.16 
 
 		 278 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  49.38 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  49 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  49 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  47.79 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 281 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  47.97 
 
 		 338 aa  248  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 273 aa  244  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  47.79 
 
 		 285 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  47.79 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  47.79 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  38.75 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  36.8 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  33.06 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  35.27 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  31.4 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  34.44 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  36.42 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  33.9 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.52 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.17 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  29.61 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.39 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.66 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.43 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.47 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.74 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  27.59 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.51 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  31.61 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.08 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  28.99 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.91 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  29.82 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  26.58 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  31.21 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  30.43 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  29.38 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  26.79 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  28.81 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  32.41 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.47 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  27.92 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  28.25 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  25.12 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  29.93 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  24.17 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  27.83 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  30.66 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.07 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.64 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  22.98 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  30.67 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  27.4 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2821  regulatory protein GntR HTH  30.37 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.39 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  28.82 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>