More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1289 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1289  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.16 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  29.22 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13077  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 490 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.207808  normal  0.861389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  32.31 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  31.74 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2591  GntR domain protein  30.77 
 
 		 501 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00937291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  27.8 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  27.35 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  29.52 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4555  regulatory protein GntR HTH  26.47 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  27.93 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1986  regulatory protein GntR, HTH  28.38 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.55 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  26.64 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  26.7 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  30.66 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  29.39 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  29.39 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  31.42 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  26.92 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  27.92 
 
 		 338 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  28.27 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4707  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  30.5 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4157  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4311  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173639  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.6 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4081  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  28.76 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  27.95 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  27.84 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  27.39 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  30.85 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  28.76 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.8 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  28.19 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1688  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0152268  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  25.54 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.08 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.48 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  25.11 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  33.33 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  29.24 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  27.89 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  29.29 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  28.3 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  27.23 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  27.97 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  26.69 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  28.85 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  27.97 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>