More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4471 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  58.56 
 
 
253 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  55.08 
 
 
246 aa  229  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  51.56 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  54.13 
 
 
251 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  45.76 
 
 
246 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
246 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  43.48 
 
 
260 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  46.46 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  40.18 
 
 
244 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 
261 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  41.44 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.34 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.91 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.6 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.8 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.35 
 
 
250 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.6 
 
 
254 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.04 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.8 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.86 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.93 
 
 
263 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  35.2 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.51 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  33.49 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.17 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.55 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  31.96 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  28.57 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.21 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.14 
 
 
255 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.3 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  30.4 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.25 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  32.89 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.47 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
251 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  33.54 
 
 
233 aa  79  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.14 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  30.43 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  34.76 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.84 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.59 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.58 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.24 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  32.11 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.2 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.97 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.65 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  34.32 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  30.58 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  25.97 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  31.53 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  34.38 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.07 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  33.12 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  31.52 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.49 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>