More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3487 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  66.36 
 
 		 233 aa  287  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  57.08 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 211 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  55.19 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  54.81 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 211 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  57.45 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  57.98 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  51.42 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  50.24 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  48.11 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 284 aa  132  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 235 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 227 aa  128  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  36.45 
 
 		 230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 262 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  36.27 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  35.98 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  36.87 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 252 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>