More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1013 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 211 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  67.62 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 211 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 211 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  63.81 
 
 		 211 aa  264  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  65.26 
 
 		 215 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  61.61 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  64.79 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  58.82 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 233 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  50.97 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  47.74 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  49 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  47.03 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  41.87 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  43.17 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.68 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  111  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 241 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.18 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  36.6 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  36.27 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>