More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5139 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  77.54 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  52.15 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 228 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 229 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  52 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  48.58 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  51.24 
 
 		 274 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  46.41 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  48.83 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  42.59 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  45.81 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  40.91 
 
 		 230 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 214 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  43.06 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 239 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  35.98 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  34.76 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.51 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 226 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>