More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2509 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  81.04 
 
 		 211 aa  343  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  80.57 
 
 		 211 aa  342  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  75.83 
 
 		 211 aa  318  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 211 aa  317  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  70.62 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  73.36 
 
 		 215 aa  296  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  75.96 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 215 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  55.87 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  51.67 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 239 aa  137  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 235 aa  118  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.85 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.86 
 
 		 230 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 249 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 222 aa  99.8  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 243 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  36.51 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 229 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 256 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2793  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>