More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4139 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  99.22 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  98.82 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  98.82 
 
 
255 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  98.43 
 
 
255 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  89.69 
 
 
262 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  89.69 
 
 
262 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  89.69 
 
 
262 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  95.38 
 
 
238 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  75.97 
 
 
256 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  76.27 
 
 
241 aa  358  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  73.89 
 
 
233 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  55.76 
 
 
239 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  57 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  57 
 
 
241 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  52.65 
 
 
234 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  54.25 
 
 
231 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  52.94 
 
 
230 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
240 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  53.7 
 
 
240 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
238 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  53.7 
 
 
240 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  54.55 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  52.25 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  50.94 
 
 
232 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
253 aa  202  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
239 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  49.08 
 
 
235 aa  195  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 
220 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  46.26 
 
 
226 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  45.7 
 
 
222 aa  188  8e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  47.17 
 
 
237 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
222 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  45.93 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  44.91 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  46.63 
 
 
214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  45.71 
 
 
220 aa  181  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  47.19 
 
 
239 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  46.05 
 
 
237 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 
229 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
234 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  39.01 
 
 
233 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
250 aa  126  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
233 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 
231 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
229 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
228 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
228 aa  115  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
226 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 
209 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
227 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
229 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
223 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
244 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
232 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.73 
 
 
237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
235 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
257 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
230 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
265 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
242 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
237 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
253 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 
239 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 
263 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
223 aa  102  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 
227 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
211 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
229 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
245 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
235 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
229 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
225 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
222 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
231 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
231 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
215 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
217 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
211 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
225 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
211 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 
227 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.5 
 
 
263 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
223 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 
238 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 
233 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
229 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 
228 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>