More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0723 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  74.6 
 
 		 248 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  79.91 
 
 		 237 aa  347  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  80.37 
 
 		 244 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  51.67 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  50.72 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  45.36 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  49.02 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  46.39 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  45.36 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  44.55 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  48.33 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  44.83 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 		 230 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  46 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  43.65 
 
 		 216 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  43.55 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  46.8 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  45.32 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  42.64 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 216 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.96 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.22 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  36.84 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.69 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>