More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0909 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  90.57 
 
 		 212 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  57.08 
 
 		 223 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 233 aa  224  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  52.91 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 211 aa  214  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 232 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  53.37 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 244 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  46.89 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  47.18 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  44.39 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 229 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  34.57 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 245 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 228 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  33.7 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  34.24 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 239 aa  104  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  35.12 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  32.12 
 
 		 237 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 254 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>